在化妆品生产许可证的办理过程中，为了避免工艺上的交叉污染，需要从多个方面进行严格控制和规划。以下是一些关键的步骤和措施：
生产厂区的布局应合理规划，生产区和非生产区的划分明确。化妆品生产区应远离污染源，动力系统和“三废”处理系统等辅助设施也不应对生产环境造成污染。
车间内部的布局同样重要。生产区应有足够的面积与空间高度，以便于设备的安装和原辅材料的存放。不同化妆品的生产线应独立设置，避免中间体之间的混杂。对于存放待检原料、半成品、工器具清洗及存放间、清洁工具间、原辅料的加工处理区等，都应合理规划面积，生产流程的顺畅进行。
在生产工艺方面，应按照工艺流程顺向布置，尽量减少生产流程的迂回和往返，以降低交叉污染的风险。原辅料和成品的出入口应分开设置，防止原料、中间体和半成品之间的交叉污染。对于极易造成污染的物料和废弃物，可以设立专用出入口，进行单独处理。
车间内部应设有物料的中间站，用于存放物料、中间产品、待验品和成品。中间站的面积应足够大，以便于明确分区，减少差错和交叉污染的可能性。
较后，厂房的设计和建造应考虑到防止昆虫、鸟类、鼠类等动物的进入，以避免它们对化妆品生产造成污染。
避免化妆品生产过程中的交叉污染需要从厂区布局、车间布局、生产工艺、物料管理等多个方面进行综合考虑和控制。只有在这些方面都做到严格规范，才能化妆品生产的安全和卫生，从而顺利获得化妆品生产许可证。
