医疗器械经营许可证和医疗器械经营备案在多个方面存在显著区别，以下是详细对比：
一、定义与适用对象
医疗器械经营许可证：
定义：是经营第三类医疗器械所必需的法定证件。
适用对象：经营具有较高风险、需要采取特别措施严格控制管理以保证其安全、有效的第三类医疗器械的企业。
医疗器械经营备案：
定义：是针对第二类医疗器械的监管措施，企业需要向相关部门提交产品信息以进行备案。
适用对象：经营具有中度风险、需要严格控制管理以保证其安全、有效的第二类医疗器械的企业。
二、申请条件与要求
医疗器械经营许可证：
申请条件更为严格，除了满足第二类医疗器械经营备案的所有条件外，还需具备符合医疗器械经营质量管理要求的计算机信息管理系统，保证经营的产品可追溯。
质量管理人员需在职在岗，不得兼职。
医疗器械经营备案：
申请条件相对宽松，但仍需满足一定的要求，如具有2名以上相关工作人员、具有超过70平方米以上的经营场所、具有与经营范围和经营规模相适应的贮存条件等。
备案可以兼职。
三、证书载明内容与有效期
医疗器械经营许可证：
载明许可证编号、企业名称、法定代表人、企业负责人、住所、经营场所、经营范围、库房地址、发证部门、发证日期和有效期限等事项。
有效期为5年，有效期届满需要延续的，需依照有关行政许可的法律规定办理延续手续。
医疗器械经营备案凭证：
载明编号、企业名称、法定代表人、企业负责人、住所、经营场所、经营方式、经营范围、库房地址、备案部门、备案日期等事项。
有效期为使用，但需确保备案信息的真实性和准确性，并在产品发生变化时及时更新备案信息。
四、申请流程与周期
医疗器械经营许可证：
申请流程相对复杂，需提交的材料较多，且需经过受理部门对申请资料的审查，必要时组织上门核查。
申请周期较长，通常需要60个工作日左右才能下发证书。
医疗器械经营备案：
申请流程相对简单，只需将产品的相关信息提交给相关部门进行备案即可。
申请周期较短，通常需要10个工作日左右就能下发备案凭证。
五、监管力度与频次
医疗器械经营许可证：
由于第三类医疗器械具有较高的风险，监管部门对经营此类医疗器械的企业监管更严，检查的频次更高。
医疗器械经营备案：
监管部门对经营第二类医疗器械的企业也会进行监督检查，但相对于经营许可证的监管力度和频次可能会稍低一些。
医疗器械经营许可证和医疗器械经营备案在定义、申请条件与要求、证书载明内容与有效期、申请流程与周期以及监管力度与频次等方面均存在显著差异。企业在申请时需根据自身经营的医疗器械类别和实际情况选择合适的证件进行申请。
