水光针申请马来西亚注册时，需要准备一系列证明文件和质量管理程序文件。以下是根据相关合适来源整理的主要证明文件和质量管理程序文件清单：
一、证明文件
企业资质证明
营业执照：证明企业的合法注册和经营资质。
生产许可证（如适用）：证明企业具备生产水光针等医疗器械的资质。
产品技术文件
产品说明书（IFU）：提供详细的产品描述、使用方法、注意事项等。
技术规范和标准：产品符合的技术规范和标准，满足马来西亚的法规和行业要求。
质量管理体系文件
质量管理体系证书（如ISO 13485）：证明企业建立了符合的质量管理体系。
质量手册：描述组织的质量政策和质量目标，指导质量管理体系的实施。
原材料供应商资质证明
供应商的营业执照、生产许可证、质量管理体系认证证书等，原材料的质量和合规性。
临床试验文件（如适用）
如果产品需要进行临床试验，应提供临床试验计划、报告和伦理委员会批准文件等。
其他证明文件
如产品商标注册证书、商标使用授权书（如果产品非自有品牌）、代工协议（如果产品为代工生产）等。
注册申请表和费用缴纳证明
填写并提交马来西亚医疗器械管理局（MDA）的注册申请表，并缴纳相应的注册费用。
二、质量管理程序文件
文件控制程序
规定文件的编制、审批、发放、回收、修改和销毁等流程，文件的准确性和有效性。
记录控制程序
规定记录的标识、存储、检索、借阅、复制和销毁等流程，记录的真实性和可追溯性。
购买控制程序
规定原材料和辅助材料的购买流程、供应商评估、购买验证和购买记录等，原材料的质量和合规性。
生产过程控制程序
详细描述水光针的生产过程，包括生产流程、设备操作、工艺参数、清洁和消毒等，生产过程的稳定性和产品的安全性。
检验和试验控制程序
规定产品的检验和试验流程、检验和试验设备的管理、检验和试验人员的培训等，产品的质量和性能符合标准要求。
不合格品控制程序
规定不合格品的标识、隔离、评审、处置和记录等流程，防止不合格品流入市场。
纠正和预防措施控制程序
规定纠正和预防措施的制定、实施和验证等流程，防止问题重复发生。
三、注意事项
合规性：所有证明文件和质量管理程序文件应符合马来西亚医疗器械法规和标准的要求。
完整性：文件应完整、准确、清晰，并包含所有必要的信息。
及时更新：随着法规和市场环境的变化，证明文件和质量管理程序文件应及时更新以保持其有效性。
咨询：在准备申请文件时，建议咨询MDA或的医疗器械注册咨询，以获取较新的要求和指导。
请注意，以上信息是基于一般情况下的要求整理的，具体的水光针申请马来西亚注册所需证明文件和质量管理程序文件可能会根据MDA的较新要求而有所变化。