电动吻合器作为医疗器械，从中国出口至澳大利亚，需要办理以下合法证件：
1. TGA注册证书
你需要在澳大利亚治疗品管理局（Therapeutic GoodsAdministration，简称TGA）注册你的电动吻合器。只有获得了TGA的注册证书，你的产品才能在澳大利亚市场销售。
2. AUSFTA原产地证书
如果你想利用中澳自由贸易协定（Australia-China Free TradeAgreement，简称AUSFTA）的优惠关税，那么你需要在中国海关获得AUSFTA原产地证书。
3. 出口许可证
如果你的电动吻合器包含了受控的商品或技术，那么你可能还需要在中国商务部获得出口许可证。
4. 产品检验报告
在产品出口前，你需要在中国海关获得产品检验报告，证明你的产品符合出口国的质量和安全标准。
5. 其他相关文件
根据产品特性和目的地国家的具体要求，你可能还需要准备其他相关文件，比如产品手册、技术规格书、用户指南等等。
请注意，以上信息仅供参考，具体的出口程序和要求可能会因为产品特性、目的地国家政策和法规的变化而有所不同。建议你在出口前咨询的法律顾问或相关相关机构，以所有程序和文件都符合要求[2][3]。
