三类医疗器械注册流程大致如下：
确定注册类别：根据产品实际情况确定适用的注册类别，如国产、进口、变更注册或注销，并收集相关资料。
提交注册申请：将注册申请书、医疗器械产品注册申请表、医疗器械注册证明材料等资料递交至国家食品药品监督管理总局（以下简称“”）。
材料审核：会审核申请资格、产品质量与安全、生产厂家等情况，发现问题时需提出修正意见并告知申请人。
临床试验：针对治疗性医疗器械和部分诊断性医疗器械，需要在临床上进行试验。申请人需在符合相关规定的医疗机构开展试验，并报告试验结果给。
审核：会对医疗器械的注册申请进行审核，审核通过后将颁发《医疗器械注册证》和《医疗器械标志许可证》。如果审核未通过，申请人可以进行再审或重新申请。
年度审批：医疗器械的注册证只有一年的有效期，申请人需在注册证有效期内完成年度审批。审批通过后，可继续进行生产和销售。
对于医疗器械厂房的设计，需要考虑以下方面：
合规性：确保厂房设计符合相关法规和标准，如GMP、FDA等要求。
工艺流程：根据医疗器械的生产工艺流程，合理规划厂房布局，确保生产流程的顺畅和高效。
洁净度：医疗器械生产需要保持高度的洁净度，厂房设计需要考虑空气净化系统、洁净室布局等。
设备布局：根据生产工艺和设备需求，合理规划设备布局，确保设备的运行和维护方便。
安全性：厂房设计需要考虑消防、安全等方面，确保生产过程中的安全。
可持续性：在厂房设计中考虑环保和可持续性，如采用节能设备、绿色建筑材料等。