内窥镜摄像系统主机产品注册需要准备以下材料：
医疗器械注册申请表：填写完整的内窥镜摄像系统主机产品的注册申请表，包括产品名称、型号、规格、生产厂家等信息。
技术资料：包括内窥镜摄像系统主机产品的技术规格、性能指标、结构图、电路图、使用说明书等。
质量管理体系文件：包括企业生产内窥镜摄像系统主机产品的质量管理体系文件，包括质量控制措施、质量检验标准、生产流程图等。
临床试验报告：内窥镜摄像系统主机产品需要进行临床试验，并提交临床试验报告。报告应包括试验目的、试验方法、试验结果、结论等。
其他相关资料：根据相关法规和规定，可能需要提交其他相关资料，如产品生产工艺流程图、原料清单、设备清单等。
需要注意的是，不同地区和不同类别的内窥镜摄像系统主机产品注册所需材料可能有所不同。在准备注册材料前，建议咨询相关或机构，以确保材料准确、完整并符合相关法规和规定的要求。