一、什么是增值税专用发票网上认证
公司注册网上认证是指纳税人通过扫描仪或键盘，将增值税专用发票抵扣联上主要信息（包括发票代码、发票号码、购货方纳税人识别号、销货方纳税人识别号、开票日期、金额、税额）和发票上的84位密文进行采集并转换为电子信息，将电子信息通过互联网传输给国税机关，经国税机关的防伪税控认证子系统进行84位密文解密还原，再与发票明文上的相应内容进行自动比对，产生认证结果，并将认证结果回传给纳税人的一种认证方法。
二、实行网上认证有哪些好处？
（一）公司注册网上认证为纳税人提供了方便、快捷、即时的认证方式，它消除了认证工作的时空限制，缩短了纳税人与国税局空间上的距离。
（二）公司注册网上认证软件系统提供了发票的扫描录入功能，减轻发票数据的录入工作量，方便企业使用。
（三）纳税人可以随时对取得的增值税专用发票抵扣联通过互联网进行识伪认证，及时有效地杜绝假增值税专用发票带来的经济损失。
（四）公司注册纳税人根据业务工作需要可随时通过网上认证增值税专用发票，不受税务机关上下班工作时间限制。
（五）操作简便，易于维护的要求。网上认证系统登录时自动升级，方便用户操作使用
三、如何进行网上认证
（一）首先，公司注册纳税人通过宽带接入等方式连接到互联网，并登录到国税局纳税服务网站,选择纳税服务网站上阳光通道栏目的网上税局，进入“网上税局”后，选择左边导航栏中的“网上认证”按钮既可进入网上认证系统登录页面。
（二）纳税人利用扫描仪或键盘，将增值税专用发票抵扣联上的主要信息采集并转化为电子信息。
（三）公司注册增值税专用发票电子信息加密后，通过互联网上传到国税局的认证服务器上。
（四）网上认证服务器接收到发票电子信息后解密，转发给防伪税控认证子系统，由防伪税控认证子系统对该增值税专用发票自动识伪认证。
（五）网上认证服务器将认证结果即时回传给企业端，公司注册企业端系统接收并显示该结果。
四、网上认证系统能否打印认证结果通知单及认证清单
公司注册每一张认证增值税专用发票的电子信息和认证结果，在国税局端和纳税人端都会留有记录和日志。在国税局端和纳税人端都可以打印认证结果清单
五、能否及时得知认证结果
几秒钟内即可完成一张增值税专用发票的认证，纳税人可即时获得国税机关反馈的认证结果
六、进行网上认证是否需要税务机关审批，需要到税务机关进行登记？
纳税人可到主管税务机关领取《纳税人数据电文申报及网上认证申请核准表》，也可以通过因特网到国家税务局网站下载《申请核准表》。按照填表要求如实、正确填写《申请核准表》，公司注册签字加盖公章后携带税务登记证副本、办税人员身份证复印件，到主管税务机关办税服务厅办理网上认证的确认登记。税务机关会即时受理完成登记，并将系统自动生成的密钥文件通过电子邮件或软盘方式发送给纳税人。
七、纳税人如果想通过网上认证需配备那些设备？
公司注册网上认证所需设备为计算机、发票扫描仪（也可手工录入）、打印机，计算机要求安装WIN98以上操作系统（IE6.0以上效果**）。
八、使用网上认证是否需要缴纳费用 ？
公司注册网上认证的软件、操作说明及相关培训资料由自治区国家税务局通过新疆国税纳税服务网站免费提供给纳税人使用。纳税人确因技术水平等原因，不能正确使用软件和扫描仪设备的，可自愿参加软件开发商和扫描仪供应商组织的操作培训和技术服务。
九、使用网上认证应注意哪些问题？
（一）纳税人丢失未认证的增值税增值税专用发票抵扣联，不得使用网上认证方式认证，应采用上门认证。
（二）对无法通过网上认证的或“重复认证”的抵扣联发票，公司注册企业应在收到国税机关网上认证结果信息后24小时内将发票抵扣联原件送交主管国税机关，进行确认处理。
（三）对经国税机关认证确定为“无法认证”、“认证不符”、“密文有误”、“重复认证”以及“丢失被盗”的增值税专用发票，企业如已申报抵扣的，应调减当期进项税额或补缴税款
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